剛開始使用FSM的治療人員，常常覺得太過神奇，好像學會了一種新的魔法，很想要試試看各種咒語的神奇效果。
 
不過，有些情況是臨床上必須要注意的。
並不是頻率本身有害，而是因為頻率的效果就像是湖面的倒影，會是一體兩面，必須小心評估臨床上患者是否適合。就好像Aspirin會改變血小板凝集功能，對於預防中風或心血管疾病很重要，但是若是有消化性潰瘍腸胃道出血或其他出血風險，可能就不適合使用。
 
研究發現，微電流可能會影響身體的prostaglandin，而prostaglandin和子宮收縮有關，所以FSM禁用於孕婦。這點對於大部分的電療儀器都是一樣的。
若有心臟節律器的病患也需要小心，如果是dependent type pacemaker，因為節律器會感應病患心臟的放電，所以裝有dependent-type pacemaker的病患不能使用任何的電療器材，包括FSM。若有疑慮，建議先諮詢心臟科醫師。
 
另外，FSM可以做為很好的輔助治療，幫助減輕癌症患者的疼痛、改善生活品質，但FSM不宣稱治療惡性腫瘤。
 
 
以下是建議使用時特別注意的頻率
 
3/ 13/ 51/ 58/   改善硬化、疤痕、沾黏、纖維化情況
由於當身體受傷時，傷口的修復需要一定程度的纖維化，所以當病患最近6週內有外傷、手術等任何受傷的地方，就不適合使用。
 
40/116   降低發炎反應 / 免疫系統
如果病患正處於感染的情況，就不適合壓抑免疫系統的發炎反應，因為身體會需要發炎反應來對抗病菌。如果使用40/116，或40/ 的時候，患部不但疼痛沒有減輕，反而更加疼痛，就要考慮是否有潛在的感染可能。
 
81/23,17,64,89,71   增加分泌 / 腎臟、肺臟、支氣管、中腦、腎上腺
這些組織若增加分泌，身體的反應可能會相當複雜，所以使用這樣的頻率組合時，臨床治療人員須要相當謹慎，一般情況不建議使用。
 
284/79   降低慢性發炎 / 靜脈
若懷疑深層靜脈栓塞(deep vein thrombosis) 時，不宜使用。
 
284/62   降低慢性發炎 / 動脈
若有12小時之內的外傷或血腫，不宜使用。
 
284/34,155   降低慢性發炎 / 子宮、子宮內膜
若女性處於生理期，不宜使用。